Předmluva

I. INFORMAČNÍ ZDROJE PRO UPŘESŇOVÁNÍ VÝZKUMNÉ HYPOTÉZY A VÝZKUMNÉHO PROJEKTU
1. Knihovnické služby a informační zdroje (Eva Čečková, Olga Bukačová, Soňa Janáčková)
1.1. Služby knihoven
1.2. Informační zdroje
1.3. Impakt faktor, citační index a Hirschův index
1.4. Jak citovat
1.5. Tvorba rešerší
1.6. Přehled nejužívanějších databází v lékařství

II. ETICKO-MORÁLNÍ ZÁSADY V BIOMEDICÍNSKÝCH VÝZKUMECH
2. Principy vědeckosti a vědecké etiky v biomedicínském výzkumu (Jaroslav Květina)

3. Etické aspekty klinického výzkumu (Petr Žďárský)

4. Legislativní předpoklady provádění klinických hodnocení léčiv (Roman Trubač)

5. Podmínky experimentů využívajících animální modely (Stanislav Špelda)
5.1. Experimentální modely
5.2. Animální modely
5.3. Právní normy ve vztahu k ochraně pokusných a laboratorních zvířat
5.4. Realizační podmínky pro použití zvířat v experimentální práci
5.5. Kontrolní instituce

III. VYBRANÉ METODOLOGIE PRO PŘEDKLINICKÉ VÝZKUMNÉ FÁZE A JEJICH KLINICKO-VÝZKUMNÉ APLIKACE
6. Molekulární biologie v biomedicínském výzkumu (Martin Beránek)
6.1. Analytické přístupy používané k izolaci nukleových kyselin
6.2. Amplifikační metody pro DNA analýzu in vitro
6.3. Elektroforéza nukleových kyselin
6.4. Hybridizace nukleových kyselin se specifickou sondou
6.5. Analýza polymorfismu délky restrikčních fragmentů
6.6. Klonování DNA
6.7. Sekvenování DNA
6.8. Projekt Lidský genom
6.9. Studium exprese genů
6.10. Studium interakcí mezi DNA a proteiny
6.11. Geneticky modifikované organismy
6.12. Klonování organismů
6.13. Genová terapie
6.14. Význam molekulární biologie pro současný biomedicínský výzkum a zdravotnictví
6.15. Specifické rysy biomedicínského výzkumu v oblasti molekulární biologie
6.16. Etické problémy molekulární biologie v biomedicínském výzkumu

7. Využití izotopů biogenních prvků v metabolickém výzkumu (Radomír Hyšpler)
7.1. Izotopy vodíku
7.2. Izotopy uhlíku
7.3. Izotopy kyslíku, dusíku, fosforu a síry
7.4. Rozdíly, výhody a nevýhody využití stabilních a radioaktivních izotopů
7.5. Analytika stabilních a radioaktivních izotopů
7.6. Bezpečnost stabilních izotopů
7.7. Výpočty v tracerových studiích
7.8. Základní metodologické dělení tracerových studií
7.9. Vyšetřovací metody založené na poměru 13CO2/12CO2 ve vydechovaném vzduchu

8. Metody měření buněčného dýchání, hodnocení funkce mitochondrií (Zuzana Červinková, Zdeněk Drahota)
8.1. Struktura a funkce mitochondrií
8.2. Oxygrafické hodnocení mitochondriálního systému oxidativní fosforylace
8.3. Měření spotřeby kyslíku oxygrafem OROBOROS
8.4. Respirace izolovaných buněk inkubovaných v extracelulárním a intracelulárním médiu
8.5. Respirace izolovaných hepatocytů permeabilizovaných digitoninem

9. Mikrodialýza a její využití v experimentálním a klinickém výzkumu (Norbert Cibiček, Pavel Živný)
9.1. Historie mikrodialýzy
9.2. Princip mikrodialyzační techniky
9.3. Složky mikrodialyzačního systému
9.4. Výhody a omezení mikrodialýzy
9.5. Metodologické aspekty mikrodialýzy
9.6. Využití mikrodialýzy v základním a klinickém výzkumu
9.7. Závěr

10. Analýza dechu v experimentálním a klinickém výzkumu (Alena Tichá, Petr Kocna)
10.1. Přehled metod využívajících analýzu vydechovaného vzduchu
10.2. Problematika odběru vzorku vydechovaného vzduchu
10.3. Analytické přístroje užívané při dechových testech obecně
10.4. Jednotlivé metody a jejich vlastnosti a analytická instrumentace
10.5. Obecná úskalí při interpretaci výsledků dechových testů

11. Hodnocení kvality rostlinných bílkovin v experimentálním zvířecím modelu (Alena Tichá, Radomír Hyšpler)
11.1. Význam biologické hodnoty proteinů
11.2. Dusíková bilance
11.3. Stanovení nutriční kvality proteinů experimentálně

12. Předklinické fáze lékových výzkumů (Jaroslav Květina)
12.1. Principy a zdroje farmakoterapeutických inovací
12.2. Farmakologické předklinické testy

IV. VYBRANÉ METODOLOGIE PRO KLINICKÉ STUDIE
13. Přehled základních metod a metodických přístupů používaných v klinicko-farmakologickém výzkumu (Jiřina Martínková)
13.1. Metody a metodické přístupy používané v etapách přeregistračních a poregistračních
13.2. Metody k individualizaci farmakoterapie
13.3. Metody k vyhodnocení celospolečenského významu léčiva
13.4. Specifické metody klinického hodnocení
13.5. Informace o léčivu (viz též kap. 4)
13.6. Nové směry interdisciplinárního vývoje farmakologických metod v klinice

14. Imunologické metody v klinickém výzkumu (Ctirad Andrýs, Jan Krejsek)
14.1. Buňkami zprostředkovaná imunita
14.2. Kultivace buněk imunitního systému
14.3. Stanovení solubilních markerů souvisejících s imunitním systémem
14.4. Proteomika 

V. VÝBĚR VÝZKUMNÝCH METOD V METABOLISMU A VÝŽIVĚ
15. Obecné přístupy k výzkumu v metabolismu a výživě (Zdeněk Zadák)
15.1. Studie in vitro a animální in vivo v metabolismu a výživě
15.2. Studie in vitro v metabolismu a výživě
15.3. Modely v metabolismu a výživě in vivo
15.4. Použití experimentálních diet v metabolismu a výživě in vivo
15.5. Výživové studie u člověka
15.6. Epidemiologické nutriční studie

16. Metody měření složení těla v nutričním výzkumu (Zdeněk Zadák)
16.1. Složení lidského těla na úrovni molekul a makromolekul
16.2. Metody skladby těla
16.3. Měření netukové a tukové hmoty těla pomocí stanovení celotělového draslíku
16.4. Využití zobrazovacích metod a bioimpedance ke stanovení skladby těla
16.5. Stanovení skladby těla pomocí bioelektrické impedance
16.6. Biochemické a metabolické metody měření svalové hmoty

17. Antropometrické metody a jejich využití ke stanovení složení těla (Miloslav Hronek)
17.1. Tělesná výška
17.2. Tělesná hmotnost
17.3. Hmotnostně-výškové indexy
17.4. Množství tělesného tuku
17.5. Zhodnocení stupně malnutrice měřením tloušťky kožní řasy m. triceps brachii
17.6. Hodnocení rozložení tělesného tuku
17.7. Typ obezity
17.8. Poměr pas/boky
17.9. Poměr pas/stehno
17.10. Střední obvod svalstva paže
17.11. Stanovení vrstvy podkožního tuku na principu infračervené detekce
17.12. Stanovení vrstvy podkožního tuku ultrazvukem

18. Stanovení potřeby energie (Miloslav Hronek, Zdeněk Zadák)
18.1. Metody měření energetické potřeby

19. Stanovení potřeby aminokyselin a bílkovin (Zdeněk Zadák)
19.1. Stanovení bílkovinné (dusíkové) bilance
19.2. Kreatinin-výškový index a stanovení 3-methylhistidinu
19.3. Hodnocení biologické hodnoty proteinů
19.4. Definice a stanovení potřeby esenciálních aminokyselin

20. Metody měření příjmu potravy v klinickém experimentu (Miloslav Hronek)
20.1. Přímé měření příjmu potravy
20.2. Záznamové metody
20.3. Metoda dvojitých porcí
20.4. Metoda definované stravy
20.5. Záznam příjmu potravy vážením
20.6. Metoda semikvantativního odhadu nutričního příjmu
20.7. Anamnestické metody
20.8. 24hodinový záznam
20.9. Frekvenční nutriční anamnéza
20.10. Výživová anamnéza 
20.11. Hodnocení chuťové preference

21. Metabolické funkční testy (Terezie Pelikánová, Zdeněk Zadák)
21.1. Glykemický CLAMP (Terezie Pelikánová)
21.2. Metody stanovení inzulínové senzitivity/rezistence
21.3. Technika triglyceridemického clampu (Zdeněk Zadák)

22. Nové směry ve výzkumu metabolismu a výživy (Zdeněk Zadák)
22.1. Transkriptomika ve výživě
22.2. Proteomika v nutričním výzkumu
22.3. Metabolom v nutričním výzkumu
22.4. Lipidom ve výzkumu výživy

Zkratky
Rejstřík